Филиал осуществляет контроль и координацию за деятельностью иных обособленных (структурных) подразделений ФГБУ «Главрыбвод», находящихся в зоне его деятельности.
Филиал осуществляет возложенные на него задачи непосредственно и через иные обособленные (структурные) подразделения ФГБУ «Главрыбвод»:
1. Кандалакшский экспериментальный лососевый завод, находится по адресу: Мурманская область, г. Кандалакша, ул. Рыбоводная, д. 7
2. Княжегубский рыбоводный завод, находится по адресу: Мурманская область, Кандалакшский район, поселок Зеленоборский, станция Княжая Губа
3. Умбский рыбоводный завод, находится по адресу: Мурманская область, Терский район, поселок Умба, ул. Рыбоводная, д. 10
4. Рыбоводно-мелиоративная станция расположена по адресу: Мурманская область, г. Кола, ул. Красноармейская, д. 35
Заводы вводились в эксплуатацию в период с 1931 по 1962 годы. Строительство осуществлялось в рамках программы компенсационных мероприятий по возмещению ущерба от возведения гидроэлектростанций, но основная функция это — инкубация икры и выращивание молоди семги с целью воспроизводства, на Умбском рыбоводном заводе также проводятся работы по воспроизводству дальневосточного лосося (горбуши).